Te cuento una experiencia mia de hace una semana. Tenia tomcat con una base de datos access en hasefroch y trate de migrarlo a una base de datos MySQL y tomcat en linux. Bueno, el tomcat como te ...

Como bien te dicen, sqlite. Otra opción es mysql (ahora con el workbench que tienen es MUY fácil) o PostgreSql si quieres algo abierto (open source). Si luego pretendes hacer un programa por encima ...